Mis sur cale le 2 septembre 1985, lancé le 15 novembre 1986, le bâtiment hydrographique Borda a été mis en service le 16 juin 1988. C'est le deuxième bâtiment de la série.

Il est basé à Brest et effectue des travaux hydrographiques au profit du SHOM (Service Océanographique et Hydrographique de la Marine), tout en étant rattaché organiquement, depuis le 2 juin 2000, à la Force d'Action Navale.

Basé à Brest, il a pour mission principale la réalisation de levés bathymétriques, de levés hydrographiques et la mise en oeuvre de capteurs et senseurs divers jusqu'à 1500 mètres de fond. Dans ce cadre il a ainsi remis à jour toute l'information nautique de l'approche de Pointe-Noire au Congo et Port Gentil au Gabon.

Le Borda est parrainé par la ville de Dax depuis le 5 mai 1989.